中国医学科学院（以下简称学院）成立于1956年，是国内医学科学学术中心和综合性医学科研机构。北京协和医学院（以下简称学校）由洛克菲勒基金会于1917年成立，是中国早期拥有八年制临床医学专业和护理本科教育的重要医学院。

医学院与协和医学院实行高校一体化管理体系，为协和医学院提供强大的师资和技术实力。协和医学院为医学院培养高层次人才，相互依托，优势互补，教研相长。学院设有18个研究所(及5个分支机构)、7所临床医院(含与北京共建的天坛医院)、6所学院、1所研究生院。高校拥有大量在医疗卫生领域经验丰富、学术水平高、做出贡献的专家教授。

协和医学院坚持小规模招生、高水平培训、高质量输出的宗旨。在办学实践中，凝聚了坚持医学精英教育，实施高等教育，注重能力素质培养，强调三、三、三、三、三、三、三、三、三、三、三、三化传统的办学特色。我校是较早授予博士学位和硕士学位的单位。一级学科博士授权专业点8个，一级学科硕士授权专业点3个。是国务院学位委员会对博士授权一级学科点和硕士授权一级学科点的委托学位授予单位。国家一级学科2个，国家二级学科8个，国家三级学科2个，国家培养学科1个。可分别授予医学博士、理学博士(哲学博士)、医学双博士、工程博士、医学硕士、理学硕士、工程硕士、管理硕士等学位。每年授予博士学位的人数居全国医学院校第一。现有学生4726人，其中研究生3862人占82%，普通本科生和成人本科生占13%，普通专科生占5%，呈典型的倒金字塔结构。多年来，我们培养了大量优秀的临床医学家、医学科学家、医学教育家、护理学家和医疗管理学家，为国内医学教育、医学科学研究和医疗卫生事业的进步和发展做出了积极贡献，在国内外享有很高的声誉。

高校科研实力雄厚，医学科研包括基础医学、临床医学、预防医学、药物、生物、物理、化学等与医学相关的学科，涵盖医学科学的各个领域。拥有5个重要实验室、10个部门开放实验室、2个国家工程技术研究中心、1个国家工程研究中心、1个国家工程实验室、21个其他省市实验室和工程技术中心、6个博士后科研移动站。十一五期间，承担各类科研项目6367项，累计科研项目资助22.1亿元，其中科研项目资助61%；各类科技奖励199项，其中国家科技奖24项；专利215项，新药证书7项；出版SCI论文3877篇，居全国医学院校之首。

高校拥有6家直属医院（北京协和医院、阜外心血管医院、肿瘤医院、整形外科医院、血液病医院、皮肤病医院）和近5328张病床，集综合医院和专科医院于一体，在心血管疾病、恶性肿瘤、血液疾病、疑难皮肤病、遗传性疾病、器官再造、自身免疫性疾病、内分泌疾病等重大疑难疾病的诊断和治疗方面达到国际前沿，形成了国内外著名的医疗、教学、科研紧密结合的医疗服务体系。

大学图书馆是中国历史悠久、藏书丰富的医学专业图书馆。2000年被指定为国家科技图书文献中心医学分中心，也是联合国世界卫生组织卫生与生物医学信息合作中心。藏书以生物医学书刊为主，总量超过50万册，尤其是外国医学期刊。许多重要的期刊都是从出版号成套到西藏的。目前，外国医学期刊有5000多种。此外，还有1000多本中医古籍。中国医学文献分析检索系统向全国开放，丰富的收藏资源为教学、科研和医疗工作提供了宝贵的信息和信息平台。

高校非常重视国际学术交流与科技合作，与数十个国家（或地区）的医学院校和科研机构建立了科研、教育和医疗领域的合作关系。自1985年以来，我校与哈佛大学医学院、加州大学旧金山分校医学院、密歇根大学医学院、澳大利亚西澳大利亚大学医学院、香港中国大学医学院签订了校际交流协议，交换高年级学生到另一所学校进行短期临床学习。经教育部批准，学校可以从1993年起自费接收政府计划以外的国际学生，并获准从1997年起招收来自台湾、香港和澳门的学生。

在2002年教育部、卫生部签署建设协议的基础上，在国务院领导同志、教育部、卫生部的大力支持和推广下，2006年9月，学校与清华大学密切合作，可以使用北京协和医学院-清华大学医学部作为第二名，学校仍是独立法人单位，进入211和985项目建设。两同探索我国高等医学教育改革的创新模式。

在中华民族伟大复兴的历史进程中，面对战略发展机遇，高校建立了北京协和医学院进入精英教育研究医学院，中国医学科学院进入中国医学科研创新体系核心基地和新国家医学科学院的战略发展目标。